目前我国设施蔬菜生产中普遍存在着化肥施用严重超量、秸秆使用鲜受重视、肥料运筹比较随意、专用肥料极其缺乏、施肥方法尤为不当等现象，不仅导致肥料利用率和生产效益低下，还导致土壤pH值降低、次生盐渍化比例较大、有机质含量普遍处于中低水平、硝态氮和速效磷富集、重金属积累、地下水硝酸盐超标等一系列较为严重的问题——中国农业科学院农业资源与农业区划研究所，农业部植物营养与肥料重点实验室 。
化肥施用严重超量
调查表明，全国主要设施蔬菜每亩平均化肥养分（N+P2O5+K2O）用量90.3kg，是全国农作物平均化肥养分用量的4.2倍。 主要设施蔬菜每亩平均肥料（化肥+有机肥）养分总用量158.0kg，其中N、P2O5和K2O施用总量分别为56.7kg、48.4kg和52.9kg，平均分别超出各自推荐施用量的1.2、5.3 和0.9 倍。按合理施肥条件下有机肥/有机物料替代化肥40%-50%的比例估算，设施蔬菜化肥养分减施潜力在40%以上。
秸秆使用鲜受重视
调查显示，主要设施菜区有机肥用量不合理，每亩平均有机肥养分用量65.9kg，超出适宜用量20kg左右；区域间有机肥用量不均衡现象突出。 我国设施菜田施用的有机肥一般以鸡粪、猪粪为主，含纤维素较少，对土壤腐殖质形成贡献有限，而化肥的重要替代技术之一作物秸秆使用很少。
肥料运筹比较随意
不注重设施蔬菜生长规律，对蔬菜各个时期的需肥种类及需肥量不了解，随意施肥。由于设施蔬菜具有养分吸收范围小、吸收强度大、吸收能力弱等特点，要求土壤养分供应强度大。设施蔬菜养分吸收是前期少，中后期快速增加，而土壤养分供应是前期过多，中后期明显不足。常常造成土壤养分供应和设施蔬菜养分吸收明显不同步，这与前期基肥化肥施用过多、中后期化肥运筹不合理等密切相关。 调查指出，全国设施蔬菜基肥化肥养分用量占化肥（基肥+ 追肥）养分总量比例过高，平均达到42.5%。
专用肥料极其缺乏
蔬菜要求钾多磷少，一般N∶P2O5∶K2O吸收比例为1∶0.3-0.5∶1.0-1.5。 据调查，设施蔬菜施用的化肥品种大多不符合蔬菜生产要求，比较适合蔬菜养分需求的专用肥、水溶性肥料等专用新型化肥品种数量不到专门针对蔬菜研发的肥料品种总数的20%，而高磷化肥品种如磷酸二铵、三元复合肥、冲施肥等占较大比例，导致设施蔬菜磷施用比例远超需求比例。
施用方法尤为不当
我国设施蔬菜生产中大水大肥现象很普遍，菜农习惯“肥大水勤，不用问人”，“大水大肥，肥随水走”的管理模式，灌溉水和肥料的投入量远远超过了蔬菜实际需求量。比如多年沿袭的传统做法是蔬菜定植后浇一次大水，一周后再浇一次缓苗水，而实际上小苗只需少量小水即可满足要求。 设施蔬菜肥料过量和不合理施用不仅导致肥料利用率和生产效益低下，还导致土壤质量退化、地下水硝酸盐超标、氧化亚氮排放和氨挥发引起的大气污染等一系列较为严重的问题。 土壤质量退化主要表现在以下几方面：
1、土壤pH值降低，现今设施管理措施导致土壤向酸化趋势发展；
2、土壤次生盐渍化比例较大，设施菜田土壤盐分含量高出露地菜田近1倍；
3、土壤有机质含量普遍处于中低水平，仅12.1%的设施菜田达到肥沃菜田土壤有机质含量40-50g·kg-1的标准；
4、土壤硝态氮和速效磷富集，设施土壤硝态氮和速效磷大量积累，对生态环境构成了严重威胁，覆盖面积超过设施蔬菜的50%；
5、土壤重金属积累，设施菜田土壤中重金属Cu、Zn和Cd呈逐渐积累的趋势，采样区设施菜田土壤Cd总体上处于污染警戒级状况。
技术对策
化肥减量增效，协调养分比例，实现精准平衡施肥 。
重点协调好三个平衡：一是养分投入与产出的平衡；二是各种养分比例的平衡（针对土壤养分不平衡加剧、蔬菜生理病害增多等问题，需重视Ca、B、Zn、Fe 等施用）；三是施肥时期养分平衡（基追肥比例与数量平衡），实现设施蔬菜养分供应与吸收的同步调控。
生物肥/有机肥/有机物料部分替代化肥，培肥土壤，减施化肥 。
土壤基础地力是实现作物产量潜力的关键因子。适于区域养分资源特点的生物肥/有机肥/有机物料与化肥优化配施（或菌剂/高碳有机肥与化肥优化配施），能稳定提升土壤功能，加速养分循环利用，减施化肥，协调土壤养分与能量（碳）之间的平衡，提高土壤有机质，以保持设施菜田土壤高效生产和持续利用。
施用专用新型化肥，优化养分配比和功能，减施传统化肥。
根据设施菜田土壤肥力状况、蔬菜品种、种植茬口等，推广应用适合蔬菜生长特点和养分需求的专用新型化肥。设施蔬菜专用肥/水溶性肥料养分配比更趋合理，对调节土壤磷素，促进土壤养分均衡供应，提高肥料利用率，增产改质具有重大作用。设施蔬菜缓控释肥可延缓肥效期，调控养分供应强度和数量，减少追肥次数。增效复混肥可提高肥效，改善土壤结构，保持土壤健康，增产改质。
推广水肥一体化技术，节水节肥，克服土壤盐化。
水肥一体化技术是未来农业中具有广阔前景的新技术，是设施蔬菜生产中最具潜力发展的技术。
推广适于区域和作物特点以及生产实际需求的以平衡水肥调控为核心的水肥一体化技术，能按设施蔬菜生长各阶段对养分的需求和土壤养分的供给状况，将融为一体的水肥适时、定量、均匀、准确地输送到蔬菜根部土壤，具有节工、节水、节肥、节药、高产、高效、优质、环保等优点。
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